En el año 1872 llega a San Fernando un grupo de ocho religiosas pertenecientes a la Congregación de las Hijas de la Caridad para organizar el Hospital. En 1878, bajo la tuición de Sor Julia, se amplía su construcción y, en el año 1884, con fondos donados por doña Mercedes Gómez viuda de Valenzuela, se inicia la construcción de la actual capilla, que quedó totalmente concluida en 1889.
Es un edificio de ladrillo finamente trabajado con todo el borde superior y sus cornisas formando una delicada filigrama.
Actualmente la capilla se encuentra completamente restaurada, ya que tras el terremoto de 1985 quedó con graves daños. Puede ser visitada de 10.00 a 13.00 horas y todos los Sábados se realiza misa a las 18.00 horas.